Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM, UMR 7245 CNRS-MNHN,
https://mcam.mnhn.fr/fr), Paris et plus particulièrement au sein du plateau technique de
spectrométrie de masse bio-organique du MNHN ainsi qu’au sein de la Plateforme d’Analyse
Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO, http://pappso.inrae.fr/ UMR MICALIS/INRAE),
Jouy-en Josas.
Missions
Dans le cadre du projet ANR CuRiPP, vous serez accueilli(e) dans l’Unité Molécules de
Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM, UMR 7245 CNRS-MNHN,
https://mcam.mnhn.fr/fr), Paris et plus particulièrement au sein du plateau technique de
spectrométrie de masse bio-organique du MNHN ainsi qu’au sein de la Plateforme d’Analyse
Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO, http://pappso.inrae.fr/ UMR MICALIS/INRAE),
Jouy-en Josas. Au sein de ces deux plateformes qui comportent des équipements et
méthodologies complémentaires, vous serez chargé(e) de la caractérisation d’une nouvelle
modification post-traductionnelle portée par des peptides d’origine bactérienne impliqués
dans la tolérance au cuivre. Vous serez impliqué(e) dans la préparation des échantillons,
depuis la culture bactérienne à l’extraction, et surtout dans leur analyse via des
méthodologies de peptidomique bottom-up et top-down (acquisition et analyse de données
LC-MS/MS). Votre activité inclura des développements méthodologiques (mise en place
et/ou optimisation de méthodes).
Activités
Préparation des échantillons : cultures bactériennes, extraction des peptides modifiés
produits à partir des culots bactériens (extraction fast-prep puis extraction sur support
solide) ;
Optimisation des conditions d’analyse LC-MS/MS ciblée et non ciblée, bottom-up ou top-
down, en mode CID, ETD, HCD et EThcD ;
Etude des interactions peptide modifié / cuivre par spectrométrie de masse ;
Coordination des analyses conduites au sein des deux plateformes d’analyse ;
Traitement des données par bioinformatique (logiciels PEAKS, BYONIC, et logiciel
« maison » de la plateforme PAPPSO pour l’analyse de modifications inconnues) ;
Reporting auprès des responsables et partenaires du projet ANR CuRiPP.
Diplôme
Master 2 de chimie analytique ou équivalent.
Expérience en analyse LC-MS/MS de peptides et/ou protéines sur un spectromètre haute
résolution (Q-TOF ou orbitrap) ;
Expérience en traitement de données de protéomique (interrogation de bases de
données). Une expérience en analyse de modifications post-traductionnelles serait un plus.
Communication scientifique à l’écrit et à l’oral ;
Bon sens de l’organisation ;
Anglais parlé et écrit maitrisé.
Capacité à travailler en équipe sur deux sites différents, à interagir avec des
bioinformaticiens et des biologistes, à organiser son temps avec une grande autonomie.
Lieu de mise en œuvre de l’activité
Muséum National d’Histoire Naturelle, UMR 7245 CNRS MCAM, Equipe BIM – CP54, 63 rue
Buffon, 75005 France ;
UMR MICALIS, PAPPSO Bâtiment 526 Domaine de Vilvert 78352 Jouy-en-Josas Cedex,
France.
Contrat de travail
Type : CDD de droit public
Durée : 18 mois
Début du contrat : 14/11/2022
Quotité : 100%
Salaire : Environ 2000 € net mensuel incluant une participation aux frais de transport
Responsables
Séverine Zirah Muséum National d’Histoire Naturelle, UMR 7245 CNRS MCAM, Equipe BIM
– CP54, 63 rue Buffon, 75005 France, Tél : +33(0)1 40 79 31 40, Email :
severine.zirah@mnhn.fr (site MNHN) ;
Céline Henry UMR MICALIS, PAPPSO Bâtiment 526 Domaine de Vilvert 78352 Jouy-en-
Josas Cedex, France (site PAPPSO), Tél : +33(0) 34 65 27 56, Email :
celine.henry@inrae.fr (site INRAE).
